Các chấm đỏ và xanh muốn gặp nhau, nhưng chúng không có tay hoặc chân để chúng di chuyển, mà các chấm có hình tròn, nghĩa là chúng có thể lăn. Bạn cần sử dụng cây bút chì thần kỳ và sự khéo léo của mình. Để các chấm di chuyển lại gần nhau hơn, hãy vẽ một đường hoặc hình để các quả bóng lăn xuống và va chạm với nhau. Vượt qua các cấp độ, sáu cấp độ đầu tiên đã có sẵn và bạn có thể chọn bất kỳ cấp độ nào, không cần tuân theo thứ tự, bạn cần phải vượt qua mọi cấp độ để có quyền truy cập vào các cấp độ còn lại trong Brain Dots.