Lập kế hoạch chiến đấu trong Ninja Wars: Battle Simulator biến việc chỉ huy một đội quân thành một bài kiểm tra về chiến thuật và khả năng thay đổi đội hình của bạn kịp thời trước khi trận chiến bắt đầu. Bạn phải tập hợp các chiến binh, cố gắng phân tích nhanh lực lượng của kẻ thù ở mọi giai đoạn của quá trình chiến lược này. Theo dõi cẩn thận vị trí của các cung thủ và triển khai thương binh kịp thời để ngăn chặn hai bên sườn đột phá và nhanh chóng đánh bại lực lượng ninja của đối phương. Với mỗi chiến thắng và chiếm thành công các vị trí trong Ninja Wars: Battle Simulator, bạn sẽ được thưởng điểm trò chơi. Phản ứng nhanh trước hành động của kẻ thù và tính toán chính xác quy mô quân đội sẽ giúp bạn đối phó với mức độ phức tạp ngày càng tăng của các trận chiến. Khả năng phối hợp khéo léo hành động của các loại quân khác nhau sẽ là chìa khóa dẫn đến chiến thắng quân sự của bạn.
