Ninja dành vài giờ mỗi ngày để huấn luyện, và điều này là cần thiết để không mất phong độ và mất mặt vào thời điểm quan trọng. Người anh hùng của trò chơi Jungle Runner là một chiến binh lành nghề và giàu kinh nghiệm, nhưng quá trình huấn luyện không còn làm anh hài lòng nữa, nó đến với anh quá dễ dàng, đồng nghĩa với việc anh không phát triển được. Vì vậy, người anh hùng quyết định đi vào rừng và chạy thẳng đứng xuyên qua những tán cây. Anh hùng sẽ lao lên với tốc độ đáng kinh ngạc và nhiệm vụ của bạn là đảm bảo rằng anh ta không va chạm với bất cứ thứ gì hoặc bất kỳ ai. Hóa ra ninja của chúng ta không đơn độc trong rừng, ngoài ra, những con ong đột biến trong Jungle Runner sẽ cố gắng ngăn chặn anh ta.