Một trong những ninja rùa quyết định tham gia cuộc đua với lũ quái vật. Đây là một công việc mạo hiểm, bởi vì quái vật có thể nuốt chửng đối thủ trên đường đi. Nhưng rõ ràng anh hùng của chúng ta muốn cảm giác mạnh, và bạn sẽ giúp anh ta sống sót và thậm chí giành chiến thắng trong cuộc đua kỳ lạ này có tên là Ninja Runner Fighter. Ngay khi có tín hiệu, bạn cần lao về phía trước, trèo tường thẳng đứng, nhảy qua chướng ngại vật. Một ninja có thể khéo léo bám lấy bất kỳ con quái vật nào đang chạy phía trước và nhờ đó tiết kiệm sức lực, sau đó lao về đích và vượt qua mọi người. Sử dụng chiến lược khác nhau để giành chiến thắng Ninja Runner Fighter.