Các trận chiến theo mùa bắt đầu trong Naruto Free Fight: Season 2. Vào trận: Naruto Uzumaki, Sasuke Uchiha và Kakashi. Chọn một anh hùng mà bạn sẽ giúp đánh bại các đối thủ và bạn sẽ được chuyển đến vị trí nơi trận chiến sẽ bắt đầu trực tiếp. Một số kẻ thù sẽ tấn công nhân vật của bạn cùng một lúc. Họ sẽ đến từng người một, sau đó theo nhóm. Với sự trợ giúp của các phím ZX, bạn phải buộc đấu ngư đẩy lui các cuộc tấn công, và tốt hơn là bạn nên tự tấn công và tiến lên phía trước, thu thập tiền thưởng và vượt qua các cấp độ. Đánh trúng đối thủ của bạn bằng những cú đấm và đá chính xác. Chỉ sử dụng khả năng đặc biệt của bạn trong những trường hợp cực đoan, khi sẽ có quá nhiều kẻ thù trong Naruto Free Fight: Season 2.