Để trả lại tự do cho người dân của bạn, bạn, với tư cách là chiến binh dũng cảm nhất và dũng cảm nhất, sẽ phải đi đến thế giới bóng tối và chiến đấu với kẻ gieo rắc bóng tối cho vùng đất của bạn. Song song với thế giới của chúng ta, có một bóng tối, nó gần giống như chúng ta có thành phố, lục địa, tiểu bang, nhưng bóng tối ngự trị ở đó. Bạn đã tìm thấy một cánh cổng đưa bạn đến những vùng đất đáng sợ và bắt đầu cuộc hành trình xuyên qua chúng cho đến khi bạn gặp được tay đua đẫm máu của Eidolon, kẻ là thủ phạm của những rắc rối xảy đến với người dân của bạn. Bạn sẽ đến thăm châu Âu đen tối và thăm Ai Cập cổ đại, nơi thời gian đã đứng yên và đất nước được cai trị bởi tên bạo chúa độc ác Pharaoh. Chiến đấu với quái vật, họ tạo nên đội quân của nhân vật phản diện trong Hexen II.