Naruto từ lâu đã không phải là một thiếu niên bồn chồn không biết khả năng của mình, nhưng vẫn rất khó để gọi anh ta là một kinh nghiệm ninja khôn ngoan. Tuy nhiên, anh ta có một đội và họ sẵn sàng chiến đấu với các thế lực đen tối để giành quyền trở thành một thủ lĩnh shinobi vĩ đại. Ở giai đoạn của trò chơi Ninja Runner Runato, bạn có thể giúp anh hùng đánh bại kẻ thù tiếp theo, dòng chảy không bị khô. Số lượng đối thủ là lớn và anh hùng thiết lập tốc độ. Anh ta sẽ chạy nhanh, và bạn làm cho anh ta phản ứng với những trở ngại sắp tới, cả animate và vô tri.