Nhìn vào Vương quốc Nấm, một trường hợp khẩn cấp lại xảy ra - Công chúa Peach bị bắt cóc. Nhưng lần này Bowser độc ác không có gì để làm với nó, vì nó không đáng ngạc nhiên. Điều đáng thương đã bị một con ma xấu xa kéo đi và bay cùng con tin đến mặt tối của một thế giới hoàn toàn khác, không thuộc về nơi Mario sống. Thợ sửa ống nước dũng cảm sẽ phải băng qua thế giới Minecraft và tìm ra kẻ bắt cóc. Khi ở trong một lãnh thổ nước ngoài, Mario sẽ trở thành những cư dân khối và điều này không có gì đáng ngạc nhiên, anh ta không cần phải nổi bật. Giúp người anh hùng trong Super Mario MineCraft Runner chạy dọc theo một con đường dài với những chướng ngại vật thu thập tiền xu.