Trong thế giới pixel bắt đầu ngày tận thế. Người ta không biết đám người chết sống đến từ đâu, hiện đang tấn công các thành phố nhỏ và giết người và biến chúng thành những nơi tương tự. Nhưng có những người dũng cảm trên thế giới đã cầm vũ khí để bảo vệ các khu định cư của họ. Bạn trong trò chơi Pixel Shot sẽ là một trong số đó. Nhân vật của bạn sẽ phải chạy qua các đường phố trong thị trấn và tìm thấy tất cả các thây ma. Với sự trợ giúp của vũ khí mạnh mẽ của mình, anh ta bắn vào chúng sẽ có thể tiêu diệt tất cả quái vật. Trên đường đi, anh ta sẽ phải thu thập nhiều vật phẩm khác nhau để giúp anh ta trong cuộc chiến chống lại xác sống.