Nhiệm vụ của bạn trong game Mergetopia là lấp đầy vị trí của thế giới dưới nước. Để làm điều này, bạn sẽ sử dụng chức năng hợp nhất. Bấm vào bong bóng, sao biển sẽ xuất hiện từ chúng. Hợp nhất hai ngôi sao lại với nhau sẽ tạo ra một chiếc vỏ, và việc hợp nhất những chiếc vỏ sẽ tạo ra một con cua. Bằng cách này, bạn sẽ dần dần lấp đầy quần xã. Bạn nhận được cá ngựa, bạch tuộc và rất nhiều loại cá từ nhỏ đến khổng lồ. Mỗi sinh vật được tạo ra đều mang lại tiền xu, bạn có thể dùng chúng để mua cư dân mới và lấp đầy hồ chứa nhanh hơn trong Mergetopia.
