Thế giới nước thường nguy hiểm và khó lường; luôn có một cuộc đấu tranh sinh tồn giữa các cư dân của nó và trong trò chơi Fish Runner, bạn sẽ giúp một số sinh vật biển sống sót và thậm chí đánh bại các đối thủ. Nhân vật đầu tiên của bạn là một chú cá heo dễ thương cần được hướng dẫn qua kênh, thu thập pha lê và tiền, cũng như vượt qua hoặc phá hủy các chướng ngại vật. Đặc biệt chú ý đến các tinh thể, chúng là những thứ lấp đầy thang tuổi thọ của cá của bạn. Điều này rất quan trọng vì ở vạch đích sẽ có một cuộc đấu tay đôi với kẻ thù và nếu không đủ sinh lực, bạn sẽ không thể đánh bại kẻ thù trong Fish Runner.
