Square trong Catching the Flag muốn thoát ra khỏi hầm mộ dưới lòng đất, nhưng để làm được điều này anh ta cần phải đạt được lá cờ ở mỗi màn chơi. Tổng cộng có mười người trong số họ và bạn phải giúp anh hùng vượt qua chướng ngại vật. Hình vuông có thể nhảy và trượt, điều này sẽ giúp bạn tránh được gai và lỗ một cách an toàn. Ngoài ra, ở mỗi cấp độ tiếp theo, các chướng ngại vật bổ sung sẽ được thêm vào, bao gồm các quả bóng màu đỏ và các vật thể khác liên tục di chuyển theo các hướng khác nhau. Mức độ khó tăng dần trong Bắt Cờ.
