Trong phiên bản kỷ niệm một nghìn năm cuộc phiêu lưu của chú khỉ vui vẻ trong Monkey Go Happy Stage 1000, chủ đề về hàng nghìn sẽ được diễn ra. Con khỉ quyết định tổ chức lễ tốt nghiệp bằng cách đến thăm một hang động bí ẩn khác, nơi cô sẽ gặp một samurai và một hiệp sĩ. Samurai bị mất đồng tiền vàng, còn hiệp sĩ bị mất mũ bảo hiểm và tấm che mặt. Họ nhờ chú khỉ giúp tìm đồ thất lạc, đồng thời làm sáng tỏ bí mật của hang động. Nó chứa đầy những nơi ẩn náu và những dòng chữ kỳ lạ. Có những hốc hình trên tường cần được lấp đầy bằng các bức tượng nhỏ của đồ trang trí tương ứng trong Monkey Go Happy Stage 1000.
