Nhiệm vụ của bạn trong Base Defense 3D là đảm bảo an toàn cho căn cứ, xung quanh đó đám zombie bắt đầu tích tụ. Nếu bạn không làm gì, lũ xác sống sẽ đột nhập cổng, đánh sập các bức tường và tiêu diệt tất cả mọi người đang ẩn náu trong căn cứ. Cần phải bổ sung càng nhiều tháp bắn càng tốt, đặt chúng xung quanh toàn bộ chu vi. Họ sẽ bắn ở chế độ tự động. Người anh hùng sẽ phải định kỳ nhảy ra ngoài căn cứ để thu thập các bó tiền bắt được và dùng chúng để củng cố căn cứ trong Base Defense 3D.
