Vì lý do nào đó, hầu hết những người ngoài hành tinh đến không gian chơi game đều bắt cóc động vật nuôi trong nhà: cừu hoặc bò. Trò chơi Paper UFO cũng sẽ không ngoại lệ. Bạn sẽ điều khiển một chiếc đĩa bay để đón một con bò và vận chuyển nó đến một cánh cổng đặc biệt để đưa con vật đến một hành tinh khác. Khi bạn bấm vào con tàu của người ngoài hành tinh, một chùm tia thẳng đứng sẽ xuất hiện, hướng xuống mặt đất. Nếu một con vật chui vào đó, nó sẽ bắt đầu nổi lên. Trong khi đó, bạn bắt đầu di chuyển chiếc đĩa để di chuyển con bò, vượt qua mọi chướng ngại vật nguy hiểm và đến được cổng trong Paper UFO.
