Người anh hùng của trò chơi Counter-Strike: Reboot sẽ phải tham gia mười hai nhiệm vụ với sự giúp đỡ của bạn. Vì nội dung được giữ bí mật tuyệt đối nên mục tiêu sẽ được tiết lộ khi bạn hoàn thành nhiệm vụ trước đó. Đầu tiên có tên là Alpha và nhiệm vụ của bạn là đẩy lùi cuộc tấn công của những kẻ khủng bố muốn chiếm căn cứ của bạn. Trong các nhiệm vụ khác, bạn sẽ phải thực hiện các nhiệm vụ khác như: giải phóng con tin, phá hủy các căn cứ khủng bố, rà phá bom mìn, v.v. Tất cả các nhiệm vụ đều bị giới hạn về thời gian, bạn cần giải quyết vấn đề một cách nhanh chóng và hiệu quả trong Counter-Strike: Reboot.
