Một chương trình nào đó trong con người của một sinh vật rất thật, bề ngoài giống con người, muốn rời khỏi ma trận kỹ thuật số, và lý do là nó sẽ bị phá hủy trong Matrix Escape. Người anh hùng muốn tìm ra cái gọi là cửa sau và để làm được điều này anh ta cần phải di chuyển thật nhanh. Ma trận đã được xác định; nó sẽ cố gắng cắt đứt mọi con đường. Mọi thứ mà bạn có thể dựa vào sẽ biến mất trong chớp mắt, vì vậy bạn không thể nán lại dù chỉ một giây mà không ngừng tiến về phía trước, nhảy từ khối này sang khối khác. Bạn sẽ cần đến sự khéo léo, nhanh nhẹn và phản ứng nhanh nhạy trong Matrix Escape.
