Trò chơi Ball Trek Genesis Edition mời bạn đứng về nguồn gốc của Vũ trụ; toàn bộ quá trình sẽ giống như một câu đố với những quả bóng. Trên thực tế, những quả bóng màu xanh chính là những hành tinh sẽ hình thành nên hệ mặt trời trong tương lai. Nhiệm vụ là hướng dẫn một loạt quả bóng xuyên qua mê cung để đến được cổng thoát màu trắng. Trong quá trình di chuyển cần phải thu gom pin và đây là điều kiện tiên quyết. Để bóng không bị mắc vào ngõ cụt, bạn phải sử dụng nhiều lệnh khác nhau bằng các phím E, C, Q, X. Bạn có thể thay đổi cách điều khiển các quả bóng, cho phép bạn di chuyển cả về phía trước và phía sau. Ở mỗi cấp độ, các chướng ngại vật mới sẽ được thêm vào cần được đặt ở đâu đó để nhường chỗ cho các quả bóng trong Ball Trek Genesis Edition.
