Mysterious Pirate Jewels 3 sẽ cho bạn quyền truy cập vào kho báu của cướp biển. Chúng được giấu kín nhưng được tìm thấy với sự giúp đỡ của một tên cướp biển liều lĩnh đã đánh cắp bản đồ từ kẻ thù không đội trời chung của cô. Có bốn mươi lăm chiếc rương đựng đá quý trong kho, nhưng việc lấy chúng không dễ dàng như vậy. Mỗi rương chứa một cái bẫy. Để thu thập tất cả các kho báu, bạn cần tạo thành các đường gồm ba viên pha lê giống hệt nhau trở lên trên các ô lục giác có nền để xóa nền. Khi tất cả các viên đá trở nên giống nhau, cấp độ sẽ được hoàn thành trong Mysterious Pirate Jewels 3.