Những chú chim pixel giận dữ bay về phía lãnh thổ của bạn trong Flappy Crush, nhưng bạn không thể bỏ lỡ chúng và để làm được điều này, bạn cần phải khéo léo điều khiển hai đường ống kết nối với nhau khi bạn nhấp vào chúng. Nếu một con chim lọt vào giữa chúng, nó sẽ không thể sống sót. Những con chim không còn cách nào khác ngoài việc bay giữa hai đường ống, bạn phải phản ứng nhanh và ấn mạnh để không một con chim nào có thể lọt qua. Độ khó trong Flappy Crush sẽ tăng dần và nó bao gồm việc ngày càng có nhiều loài chim, đồng nghĩa với việc bạn sẽ phản ứng nhanh hơn.