Một nhóm các nhà nghiên cứu dũng cảm bắt đầu chuyến thám hiểm không gian để tìm kiếm những nền văn minh thân thiện trong Trò chơi ném bong bóng. Trong chuyến bay, một chất thù địch nào đó đã xâm nhập vào con tàu, chất này được bổ sung các bong bóng nhiều màu và đe dọa chiếm giữ con tàu từ bên trong. Các anh hùng phát hiện ra rằng họ có thể chống lại cuộc xâm lược bằng những quả bóng cùng màu bằng cách ném chúng và tạo thành nhóm gồm ba quả giống hệt nhau trở lên để tiêu diệt sau đó. Để hoàn thành một cấp độ trong Bubble Throw, bạn cần ghi được số điểm yêu cầu. Có tổng cộng năm mươi cấp độ trong trò chơi và độ phức tạp của chúng ngày càng tăng lên.
