Đội quân nhà vệ sinh Skibidi đã đột nhập vào thành phố và giờ đây không một cư dân nào có thể cảm thấy an toàn. Chúng cực kỳ tàn ác và hung hãn nhưng nhân loại lại có khá nhiều kẻ thù như vậy. Điều khủng khiếp hơn nhiều là việc chúng có thể biến con người thành đồng loại của mình và không ngừng gia tăng số lượng. Để ngăn chặn điều này trong trò chơi Skibidi Toilets: Lây nhiễm, chính quyền thành phố quyết định không cho bất kỳ người dân nào ra đường, kể cả binh lính, vì họ có thể gặp nguy hiểm. Thay vào đó, các Cameramen được mời vì họ có khả năng miễn dịch chống lại tác động của quái vật và có nhiều kinh nghiệm chiến đấu với chúng. Bạn sẽ điều khiển một trong những đặc vụ này. Hãy cầm vũ khí và bắt đầu rà soát các đường phố trong thành phố. Hãy chú ý quan sát tình hình xung quanh, vì nhà vệ sinh Skibidi có thể xuất hiện từ bất kỳ hướng nào và bạn cần phải sẵn sàng. Ngay khi bạn tìm thấy kẻ thù, hãy bắt hắn trong phạm vi và bắt đầu bắn. Đối với mỗi quái vật bị tiêu diệt, bạn sẽ được thưởng điểm và bạn có thể sử dụng chúng để bổ sung đạn dược và cải tiến vũ khí của mình. Mỗi cấp độ sẽ có một số lượng nhà vệ sinh Skibidi nhất định. Bạn cần phải loại bỏ tất cả chúng để chuyển sang giai đoạn tiếp theo trong Nhà vệ sinh Skibidi: Nhiễm trùng.
