Trong Ben 10: Brains vs Bugs, bạn sẽ phải giúp một người ngoài hành tinh màu xanh vui nhộn giải thoát những người bạn bị bắt cóc của mình. Trước mặt bạn, nhân vật của bạn sẽ hiển thị trên màn hình, nhân vật này sẽ được đặt ở một vị trí nhất định. Sử dụng các phím điều khiển, bạn sẽ hướng dẫn hành động của mình. Anh hùng của bạn sẽ phải đi dọc theo một tuyến đường nhất định, vượt qua nhiều cạm bẫy và những mối nguy hiểm khác. Trên đường đi, anh ta sẽ thu thập tiền vàng và các vật phẩm hữu ích khác sẽ mang lại cho bạn điểm trong trò chơi Ben 10: Brains vs Bugs và có thể mang lại cho nhân vật nhiều loại tiền thưởng khác nhau. Ngoài ra, nhân vật của bạn sẽ phải chiến đấu với những con bọ sẽ gặp trên đường đi của mình.
