Trong khi tiến hành trinh sát, chiến binh ninja đã rơi vào một cái bẫy và có thể bắt được samurai. Anh hùng của chúng ta đã có thể ra khỏi lồng và bây giờ anh ta sẽ cần phải trốn thoát. Bạn trong game Ninja Escape sẽ giúp đỡ các ninja trong cuộc phiêu lưu này. Nhân vật của bạn sẽ hiển thị trên màn hình trước mặt bạn, người sẽ tăng dần tốc độ và chạy dọc theo con đường. Trên đường đi của mình sẽ có những chướng ngại vật và cạm bẫy mà anh hùng của bạn sẽ phải vượt qua với tốc độ nhanh. Ngoài ra trên con đường của ninja sẽ có những samurai muốn tiêu diệt anh hùng của bạn. Bạn, sử dụng một kho vũ khí ném khác nhau, sẽ phải ném chúng vào kẻ thù. Khi bạn đánh kẻ thù, bạn sẽ tiêu diệt chúng và nhận được một số điểm nhất định cho việc này trong trò chơi Ninja Escape.
