Một nhân vật sống trong thế giới Minecraft tên là Noob cùng với những người bạn và đối thủ của mình bước vào ngôi trường quái vật mới mở. Bạn trong trò chơi Monster School sẽ phải giúp nhân vật được huấn luyện trong đó. Trước mặt bạn, trên màn hình sẽ hiển thị nhân vật của bạn, người sẽ ở trong hành lang của trường. Ở cuối sân chơi, các biểu tượng sẽ hiển thị cho biết anh hùng của chúng ta sẽ có thể tham quan lớp học và bài học nào. Bạn sẽ phải nhấp vào một trong các biểu tượng. Do đó, bạn và Noob sẽ được đưa đến lớp học, nơi bạn sẽ được giao một nhiệm vụ. Nếu hoàn thành xuất sắc nhiệm vụ, bạn sẽ được cộng điểm trong game Monster School và bạn sẽ được tham gia buổi học tiếp theo.