Những tên cướp biển đã khiến tất cả mọi người và ngay cả các ninja cũng mất kiên nhẫn và quyết định trừng phạt những tên cướp biển tự phụ. Một đội ninja đã lập một cuộc phục kích trên một trong những hòn đảo nơi những tên cướp biển thường xuyên tìm kiếm để che giấu kho báu bị đánh cắp của họ. Trong game Angry Ninja bạn sẽ giúp các ninja tiêu diệt những tên cướp biển. Những kẻ phản diện sẽ cố gắng xây dựng công sự và ẩn nấp sau chúng, nhưng những phát bắn chính xác của bạn sẽ quét sạch mọi thứ trên đường đi của chúng. Trò chơi Angry Ninja được làm theo phong cách Angry Birds, nhưng thay vì họ và lợn, các nhân vật hoàn toàn khác nhau. Bản thân các ninja sẽ trở thành đường đạn, và bạn sẽ phóng chúng vào những tên cướp biển ẩn nấp sau nhiều loại tia khác nhau trong Angry Ninja.
