Những con quái vật hình vuông vui nhộn đi khắp thế giới đã vào một ngôi đền cổ và bị mắc kẹt. Bạn trong trò chơi Square Monsters sẽ phải giúp họ ra khỏi ngôi đền. Quái vật của bạn sẽ hiển thị trên màn hình trước mặt bạn, chúng sẽ được đặt tại một trong những căn phòng của ngôi đền. Ở trung tâm của ngôi đền, bạn sẽ thấy một cổng thông tin. Nó dẫn đến cấp độ tiếp theo của trò chơi. Bạn có thể sử dụng các phím điều khiển để điều khiển hành động của cả hai nhân vật cùng một lúc. Nhiệm vụ của bạn là dẫn dắt cả hai con quái vật vượt qua mọi nguy hiểm, và khiến chúng nhảy vào cổng. Điều này sẽ đưa các anh hùng của bạn lên cấp độ tiếp theo của trò chơi Square Monsters và cho bạn điểm.