Mọi thứ trong thế giới game đã bị đảo lộn. Ở Vương quốc Nấm yên bình một thời, nơi luôn yên bình và chỉ có nấm hoặc rùa mới có thể nghịch ngợm một chút, những kẻ thù thực sự nguy hiểm bắt đầu xuất hiện - thây ma. Không phải lần đầu tiên Mario phải nhặt một vũ khí mạnh mẽ để chống lại cuộc xâm lược, nếu không thế giới sẽ kết thúc. Trong trò chơi Super Mario Shooting Zombie, bạn có thể giúp anh hùng đánh bật lũ xác sống khỏi những nơi mà chúng hy vọng sẽ ẩn náu cho đến thời điểm thuận lợi hơn. Bạn cần phải lấy xác sống từ mọi nơi bằng cách sử dụng tất cả các đồ vật có sẵn, cũng như bật lại trong Super Mario Shooting Zombie.
