Trong phần hai của Ninja Dogs 2, bạn sẽ tiếp tục giúp một biệt đội ninja chó chiến đấu với các vệ binh đến từ vương quốc mèo. Hôm nay bạn phải tấn công lâu đài của họ và bắt chúng hoặc phá hủy chúng. Ở phía trước của bạn trên màn hình, bạn sẽ thấy một khu vực nhất định, trong đó các tòa nhà sẽ được đặt. Bên trong các tòa nhà, bạn sẽ thấy những chú mèo lính. Một khẩu pháo sẽ được lắp đặt cách các tòa nhà một khoảng cách nhất định. Với sự trợ giúp của nó, bạn sẽ bắn những con chó chiến của mình và chúng bay được một khoảng cách nhất định sẽ đâm vào tường của tòa nhà và tiêu diệt những con mèo đang tấn công của nó. Để làm điều này, bạn sẽ cần tính toán quỹ đạo của các bức ảnh của mình. Sau khi tiêu diệt hết lũ mèo, bạn sẽ nhận được điểm và chuyển sang cấp độ tiếp theo của trò chơi.