Trong một thời gian, vương quốc ninja sống yên bình và phát triển, các thành phố mới được xây dựng, dân số tăng lên và sau đó những tín hiệu đáng báo động bắt đầu đến từ vùng ngoại ô. Mọi người lại bắt đầu nhận thấy ảnh hưởng của thế lực đen tối từ các ngục tối cũ. Vì vậy, vua ninja hình vuông cần phải đi xuống hầm mộ một lần nữa và dọn sạch chúng trong trò chơi Kingdom of Ninja 4. Bạn và anh ấy sẽ thấy mình đang ở lối vào mê cung và sẽ giúp anh ấy lần lượt vượt qua các cấp độ. Bạn cần phải đi từ cờ đỏ đến cửa, nhưng để làm được điều này bạn sẽ phải vận dụng sự khéo léo tối đa, vì phía trước có rất nhiều cạm bẫy. Đây sẽ là những chiếc cưa xoay, những chiếc gai nhọn, những khẩu đại bác bắn đạn đại bác từ trên tường và nhiều loại khác. Bạn cần khéo léo di chuyển giữa chúng, nhảy qua và tiến về phía mục tiêu. Quái vật sẽ tiến về phía bạn, nhưng đừng cố giết chúng, vì anh hùng của bạn không có vũ khí, tốt hơn là bạn chỉ cần bỏ qua chúng trong trò chơi Kingdom of Ninja 4 - chúng sẽ không truy đuổi bạn. Thu thập các tinh thể quý, tiền vàng và mở rương kho báu. Khi bạn đạt đến cấp độ cuối cùng và thu thập tất cả những vật có giá trị, những con quái vật bị bỏ lại sẽ bốc hơi và không còn gây ra vấn đề gì cho cư dân của vương quốc nữa.
