Trong game Kingdom of Ninja bạn sẽ đến vương quốc nơi các chiến binh ninja sinh sống. Những năm gần đây thời tiết xấu, mùa màng thu hoạch rất ít, những con quái vật khát máu cũng bắt đầu xuất hiện. Bản thân nhà vua đã quyết định chấn chỉnh tình hình vì ông phải chịu trách nhiệm về mạng sống của cư dân mình. Để làm được điều này, anh ta sẽ phải đi xuống hầm mộ dưới thành phố, vì chính từ đó mà các sinh vật bóng tối bắt đầu xuất hiện vào ban đêm. Ngoài ra, anh còn đọc trong các cuộn giấy cổ rằng những kho báu cổ xưa được giấu trong những mê cung này, và nếu chúng được thu thập hết, bùa chú tà ác sẽ bị xua tan. Bạn sẽ đồng hành cùng anh hùng của mình, người trông giống như một hình vuông màu đen với sọc đỏ trên mắt. Để đáp ứng tất cả các điều kiện từ biên niên sử cổ đại, anh ta sẽ phải đi dưới lòng đất mà không có vũ khí và chỉ có sự khéo léo đáng kinh ngạc mới giúp anh ta vượt qua tất cả các bài kiểm tra. Ngay từ những bước đầu tiên, anh ta sẽ phải đối mặt với nhiều loại bẫy, hố trên mặt đất và các gờ đá cao. Ở một số nơi bạn sẽ phải trèo tường để lên tầng tiếp theo. Nếu gặp quái vật trên đường đi thì bạn không nên cố gắng tấn công chúng, vì không có cơ hội chiến thắng. Tốt hơn hết bạn nên nhảy qua và tiếp tục tìm kiếm các rương kho báu trong Vương quốc Ninja.
