Trong tương lai xa, thây ma xuất hiện trong thế giới pixel sau hàng loạt trận đại hồng thủy và chiến tranh. Bây giờ đám người sống chết săn những người sống sót. Trong Pixel Zombies, bạn sẽ bảo vệ một trong những khu định cư của con người. Bạn sẽ cần phải tiêu diệt lũ zombie đang di chuyển theo hướng của mình. Con đường sẽ hiển thị trên màn hình trước mặt bạn. Zombies sẽ di chuyển dọc theo nó theo hướng của bạn với các tốc độ khác nhau. Bạn sẽ cần xác định các mục tiêu ưu tiên hàng đầu và bắt đầu nhấp vào chúng bằng chuột. Vì vậy, bạn sẽ tấn công những thây ma mà bạn lựa chọn và tiêu diệt chúng. Đối với mỗi kẻ thù bạn tiêu diệt, bạn sẽ nhận được một số điểm nhất định.
