Trên một trong những hòn đảo ở Thái Bình Dương, một căn cứ bí mật của chính phủ được đặt nơi các nhà khoa học tiến hành thí nghiệm trên con người. Nhưng đây là rắc rối, các đối tượng thử nghiệm đã thoát ra và tiêu diệt hầu hết các nhân viên căn cứ. Một số nhà khoa học đã tìm cách trốn thoát và nhốt mình trong căng tin của căn cứ. Trong game Cry Islands bạn sẽ phải vào đảo và tiêu diệt tất cả các dị nhân. Anh hùng của bạn sẽ được thả bằng máy bay trực thăng ở một phần nhất định của hòn đảo. Với vũ khí luôn sẵn sàng, bạn sẽ phải tiến về phía trước và cẩn thận quan sát xung quanh. Ngay khi nhận thấy kẻ thù, bạn sẽ phải nhắm vũ khí của mình vào kẻ thù và nổ súng tiêu diệt. Bắn chính xác vào kẻ thù, bạn sẽ tiêu diệt được hắn. Với mỗi lần tiêu diệt bạn sẽ được cộng một số điểm nhất định.
