Các ninja dũng cảm đã nhận được lệnh từ người đứng đầu mệnh lệnh xâm nhập vào lâu đài của một quý tộc và đánh cắp tài liệu ở đó. Bạn trong trò chơi Ninja Run Up And Down sẽ giúp anh ta trong những cuộc phiêu lưu này. Nhân vật của bạn sẽ phải chạy đến lâu đài dọc theo một con đường đi qua một khu vực nhất định. Trên đường đi, anh sẽ bắt gặp nhiều cạm bẫy và quái vật khác nhau. Chạy đến chỗ họ, bạn sẽ phải buộc anh hùng của mình nhảy lên và bay trong không trung qua tất cả những nguy hiểm này.
