Trong phần thứ hai của trò chơi Virus Ninja 2, bạn sẽ giúp một chiến binh ninja dũng cảm chiến đấu với nhiều loại virus khác nhau. Trước khi bạn xuất hiện trên màn hình, sẽ có một sân chơi mà nhiều loại vi khuẩn sẽ xuất hiện. Chúng sẽ di chuyển theo các hướng khác nhau và ở tốc độ khác nhau. Để tiêu diệt chúng, bạn sẽ cần sử dụng một thanh kiếm. Nhìn cẩn thận vào màn hình và lái các đối tượng bằng chuột. Do đó, bạn sẽ tấn công vi khuẩn và cắt chúng thành từng mảnh. Đôi khi bom có u200bu200bthể xuất hiện trong số những vật thể này. Bạn không nên vung chúng.
