Người ngoài hành tinh từ một thế giới song song xâm chiếm một trong những hành tinh trong thế giới pixel. Chúng xuất hiện từ cánh cổng nằm trong không trung và bắt đầu hình thành đội hình chiến đấu. Các lực lượng không quân của hành tinh đã được báo động. Bạn trong trò chơi Pixel War sẽ phục vụ như một phi công chiến đấu. Bạn phải bay trên tàu của bạn để gặp kẻ thù và tham gia trận chiến. Khéo léo cơ động trên tàu, bạn sẽ khai hỏa từ súng của mình và tiêu diệt tất cả các đối thủ. Bạn càng giết chúng, bạn càng nhận được nhiều điểm.
