Một nhóm khủng bố nhỏ đã bắt giữ một trong những nhà máy vũ khí hóa học. Họ lấy một số con tin làm con tin và bây giờ yêu cầu một khoản tiền chuộc từ chính phủ. Nếu họ không hài lòng với yêu cầu của họ, họ sẽ sắp xếp sự rò rỉ hóa chất và mọi thứ trong bán kính hàng trăm cây số sẽ bị đầu độc. Bạn trong game Crazy ShootFactory II sẽ cần phải ở trong đội hình các lực lượng đặc biệt để xâm nhập vào thực vật và tiêu diệt chúng.
